RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC13Q9NSE7 274 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 SACM1LQ9NTJ5 587 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 ARL5AQ9Y689 179 aa18.16■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 ARL5CA6NH57 179 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 TCF3P15923 654 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD14CQ5VZR4 134 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 TAF2Q6P1X5 1199 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM171BQ6P995 826 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 OR10T2Q8NGX3 314 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPEARQ8WU66 669 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 ATOH8Q96SQ7 321 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 C16orf96A6NNT2 1141 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 GOT2P00505 430 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 CHRNA1P02708 482 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 ALPLP05186 524 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR1AP08908 422 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 ELNP15502 786 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR1BP28222 390 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNK10P57789 538 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 CLCQ05315 142 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 CRY1Q16526 586 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 PROSER1Q86XN7 944 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 MINDY2Q8NBR6 621 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 PSMG2Q969U7 264 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 TMBIM1Q969X1 311 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 NMUR1Q9HB89 426 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 ENPP5Q9UJA9 477 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RALGPS1-208ENST00000424082 AOC2O75106 756 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 EEDO75530 441 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 CYBBP04839 570 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 PIRTP0C851 137 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS56P0CW18 603 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR1EP28566 365 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 RCAN2Q14206 197 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 UPP1Q16831 310 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 SCIMPQ6UWF3 145 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 SCD5Q86SK9 330 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 STARD8Q92502 1023 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 HPS1Q92902 700 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 MUL1Q969V5 352 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 DGCR6LQ9BY27 220 aa18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 XYLBO75191 536 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 B3GAT3O94766 335 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 GLP2RO95838 553 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 CDH1P12830 882 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR7P34969 479 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4D2P58180 307 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 UFM1P61960 85 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 IFITM3Q01628 133 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGFQ07326 219 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 LCP2Q13094 533 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 IMPG1Q17R60 797 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 CLEC4FQ8N1N0 589 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 OR13C4Q8NGS5 318 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 BTN2A3PQ96KV6 586 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 ACBD6Q9BR61 282 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 TOR3AQ9H497 397 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 SUPT3HB4E1H0 165 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 CRCPO75575 148 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTN5O94779 1100 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 PRSS23O95084 383 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 ALOX5P09917 674 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 ODC1P11926 461 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 FXNQ16595 210 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 DPY19L1Q2PZI1 675 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 STK32CQ86UX6 486 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX29P2Q8IUI4 249 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 PGBD5Q8N414 524 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 RMI1Q9H9A7 625 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 SP110Q9HB58 689 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 MTRRQ9UBK8 725 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 BAG5Q9UL15 447 aa18.13■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RALGPS1-208ENST00000424082 SEPT4O43236 478 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms