RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHUKO15111 745 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAFKO60675 156 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EDN3P14138 238 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IDSP22304 550 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPINT3P49223 89 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDH6P55285 790 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HGSNATQ68CP4 663 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MON1BQ7L1V2 547 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC38A9Q8NBW4 561 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INPP5DQ92835 1189 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM14Q96QK8 99 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LYSMD1Q96S90 227 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K3Q99759 626 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZWILCHQ9H900 591 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRAFP15056 766 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CA4P22748 312 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FECHP22830 423 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOX5P35711 763 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HALP42357 657 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL26P61254 145 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1CAP62136 330 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPYSQ14117 519 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYCP1Q15431 976 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRTM4Q86VH4 590 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GALNT16Q8N428 558 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLIP3Q96DZ5 547 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POM121Q96HA1 1249 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHST11Q9NPF2 352 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.19■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VEGFDO43915 354 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STSP08842 583 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VCLP18206 1134 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CES1P23141 567 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITKQ08881 620 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LLGL1Q15334 1064 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR19Q15760 415 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF569Q5MCW4 686 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMCO3Q6UWJ1 677 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPNS3Q6ZMD2 512 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CUZD1Q86UP6 607 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARFQ8N187 725 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COG1Q8WTW3 980 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FANCEQ9HB96 536 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NT5MQ9NPB1 228 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCSK1NQ9UHG2 260 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTORP42345 2549 aa16.18■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC168Q8NDH2 2452 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRPSAP2O60256 369 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF8O76064 485 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAPN1P07384 714 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMA2P25787 234 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RORAP35398 523 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HADHAP40939 763 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OGDHQ02218 1023 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCF4Q15080 339 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLCL1Q15111 1095 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF10Q5QP82 559 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM69BQ5VUD6 431 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCN10Q6JVE6 187 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CERS6Q6ZMG9 384 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FJX1Q86VR8 437 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGAP3Q96P47 875 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHKBQ9Y259 395 aa16.17■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9J4A7 227 aa16.16■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BRJ5 948 aa16.16■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PEX12O00623 359 aa16.16■□□□□ 0.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 E2F3O00716 465 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms