RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT1A5P35504 534 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UFM1P61960 85 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 USP7Q93009 1102 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MYLPFQ96A32 169 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS50Q96JG6 964 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf34Q96L11 122 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF347Q96SE7 839 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IL17CQ9P0M4 197 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EGFL7Q9UHF1 273 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DOLKQ9UPQ8 538 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087X1B8 175 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SAC3D1A6NKF1 404 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CFLARO15519 480 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC14L5O43304 696 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CYBBP04839 570 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K7CLP57077 242 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IQSEC1Q6DN90 963 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL23Q8NBE8 558 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR13C4Q8NGS5 318 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ9Q92806 393 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MGME1Q9BQP7 344 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP4F12Q9HCS2 524 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ECI2O75521 394 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLPXO76031 633 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HGFP14210 728 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF12P17014 697 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TACR1P25103 407 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BMPR1AP36894 532 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HPCAL1P37235 193 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH3A2P51648 485 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGR1Q14914 329 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSL3PQ5NE16 218 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 APH1BQ8WW43 257 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RDH12Q96NR8 316 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD9AQ99638 391 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRQQ9UN88 632 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0U1RQF3 1178 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ENPP3O14638 875 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS13O14921 159 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS4O75173 837 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HPRP00739 348 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOQP17081 205 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AGXTP21549 392 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BRCC3P46736 316 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AGTR2P50052 363 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCN4P51793 760 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDH1Q08174 1060 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PHKG1Q16816 387 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP68Q76N32 757 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR142Q7Z601 462 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PTOV1Q86YD1 416 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 UBTD2Q8WUN7 234 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMG2Q969U7 264 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FCRL1Q96LA6 429 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CGREF1Q99674 301 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CTRCQ99895 268 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC3Q9BY71 257 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ALG2Q9H553 416 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CAAP1Q9H8G2 361 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZIM2Q9NZV7 527 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 AKT3Q9Y243 479 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFAF1Q9Y375 327 aa3.59□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 E9PAM4 449 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA9O76027 345 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 OPRL1P41146 370 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RANBP1P43487 201 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RING1Q06587 406 aa3.58□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNAB2Q13303 367 aa3.58□□□□□ -1.84
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