RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 WDR27A2RRH5 827 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 I6L893 689 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RNF103O00237 685 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ALOX15BO15296 676 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ADAM12O43184 909 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 VNN2O95498 520 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 IGLV3-27P01718 113 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SHBGP04278 402 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GSTA2P09210 222 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ETS1P14921 441 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ERCC2P18074 760 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ATF6P18850 670 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 EPHB2P29323 1055 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GDI1P31150 447 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 STX2P32856 288 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MAGEA3P43357 314 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RRADP55042 308 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 VEPH1Q14D04 833 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NRN1LQ496H8 165 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ARMC3Q5W041 872 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KANK2Q63ZY3 851 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 VITQ6UXI7 678 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NPWQ8N729 165 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 EXTL1Q92935 676 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FATE1Q969F0 183 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SLC39A13Q96H72 371 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 C1orf74Q96LT6 269 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NMUR1Q9HB89 426 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 EURLQ9NYK6 297 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 YIPF1Q9Y548 306 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 A0A087WV48 116 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 E7EVH7 732 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 AP3B1O00203 1094 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CDC14BO60729 498 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RASGRP1O95267 797 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CSH1P0DML2 217 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CSH2P0DML3 217 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 NAT1P18440 290 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ITPKBP27987 946 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 MC4RP32245 332 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PPP3CCP48454 512 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 LMAN1P49257 510 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 GPR15P49685 360 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TBX4P57082 545 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 KCTD16Q68DU8 428 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.59□□□□□ -1.35
CCL20-202ENST00000409189 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.59□□□□□ -1.35
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