RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 POT1Q9NUX5 634 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 SMOXQ9NWM0 555 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 OCIAD1Q9NX40 245 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 GRID2IPA4D2P6 1211 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 STX7O15400 261 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC19A1P41440 591 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 MAPK9P45984 424 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ATP1A2P50993 1020 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ARSDP51689 593 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 PRPSAP1Q14558 356 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 SNAP47Q5SQN1 464 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 RANBP10Q6VN20 620 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA1328Q86T90 577 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF843Q8N446 348 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 BMPERQ8N8U9 685 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ALG3Q92685 438 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 GORASP1Q9BQQ3 440 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 FICDQ9BVA6 458 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNN4O15554 427 aa27.3■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 AGTP01019 485 aa27.3■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ADRA1AP35348 466 aa27.3■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 PMEPA1Q969W9 287 aa27.3■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 C5orf60A6NFR6 353 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 C2orf81A6NN90 581 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 A8MU76 341 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UGT1A9O60656 530 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKRD34CP0C6C1 535 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 PYGMP11217 842 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 BRAFP15056 766 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UGT1A6P19224 532 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 LPOP22079 712 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UGT1A1P22309 533 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UGT1A4P22310 534 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UGT1A3P35503 534 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 MC2RQ01718 297 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 DMPKQ09013 629 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 GPRC6AQ5T6X5 926 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 VASH2Q86V25 355 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 AMZ2Q86W34 360 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 SYCE1Q8N0S2 351 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 SPATA13Q96N96 652 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ZPBPQ9BS86 351 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UGT1A7Q9HAW7 530 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UGT1A10Q9HAW8 530 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UGT1A8Q9HAW9 530 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 FBXO8Q9NRD0 319 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 AMFRQ9UKV5 643 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 BUD23O43709 281 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UBXN7O94888 489 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 C9P02748 559 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ITGB2P05107 769 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 RPL10P27635 214 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 PSMB4P28070 264 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 HALP42357 657 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 PDE1BQ01064 536 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 KIF5AQ12840 1032 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 PEX26Q7Z412 305 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 UBL4BQ8N7F7 174 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 NKD1Q969G9 470 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 LRRC45Q96CN5 670 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 C19orf43Q9BQ61 176 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC40A1Q9NP59 571 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 IMPACTQ9P2X3 320 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ARL5AQ9Y689 179 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKS6Q68DC2 871 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 XKR5Q6UX68 686 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 CEACAM20Q6UY09 585 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM139Q8IV31 216 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 TTC13Q8NBP0 860 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF398Q8TD17 642 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 CXorf40BQ96DE9 158 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 OGFRQ9NZT2 677 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD54-203ENST00000407117 GPR39O43194 453 aa27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-203ENST00000407117 POP7O75817 140 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-203ENST00000407117 PRAMEF1O95521 474 aa27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-203ENST00000407117 AMD1P17707 334 aa27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-203ENST00000407117 CTSCP53634 463 aa27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-203ENST00000407117 DRG2P55039 364 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-203ENST00000407117 LY6DQ14210 128 aa27.26■■□□□ 1.95
ANKRD54-203ENST00000407117 LONRF2Q1L5Z9 754 aa27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms