RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 SNX2O60749 519 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 IDO1P14902 403 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 FCGRTP55899 365 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 OR4D1Q15615 310 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ITCHQ96J02 903 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC138Q96M89 665 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ACOX2Q99424 681 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CD274Q9NZQ7 290 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 LAMA3Q16787 3333 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 LDB2O43679 373 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TYMPP19971 482 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 IL10P22301 178 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 FSHRP23945 695 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 DGCR6Q14129 220 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 SEMA3AQ14563 771 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 INAVAQ3KP66 663 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 UROC1Q96N76 676 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM74Q96NL1 305 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 GPR21Q99679 349 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 GKN1Q9NS71 199 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CDC7O00311 574 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TGFBR1P36897 503 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 DNAJB13P59910 316 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 AQP6Q13520 282 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PKMYT1Q99640 499 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 KATNA1O75449 491 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CLPXO76031 633 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CDK14O94921 469 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 MMP2P08253 660 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 DCKP27707 260 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 SHMT2P34897 504 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 AGTR2P50052 363 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 DIO3P55073 304 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 IL1RL1Q01638 556 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 RGMBQ6NW40 437 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TNIP2Q8NFZ5 429 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 NUDT8Q8WV74 236 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 FEM1CQ96JP0 617 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 RNF145Q96MT1 663 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CDK15Q96Q40 435 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 UNCXA6NJT0 531 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM24O15164 1050 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 GPR39O43194 453 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TACR2P21452 398 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 GSSP48637 474 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 HERVK_113P63132 956 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PYCR3Q53H96 274 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ITIH5Q86UX2 942 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 MIER2Q8N344 545 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 C1orf74Q96LT6 269 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CEP44Q9C0F1 390 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 IQCF5A8MTL0 148 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 H0Y858 1186 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PEX11BO96011 259 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CYBAP13498 195 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms