RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 CPNE9Q8IYJ1 553 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA2013Q8IYS2 634 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 EFHBQ8N7U6 833 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 RNF217Q8TC41 542 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 OCEL1Q9H607 264 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CD320Q9NPF0 282 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CENPFP49454 3210 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CBX4O00257 560 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ACOX3O15254 700 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 HTR1EP28566 365 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 PTGER3P43115 390 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ADARP55265 1226 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 NANOGP8Q6NSW7 305 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 PROSER1Q86XN7 944 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 FNDC5Q8NAU1 212 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 SEPT8Q92599 483 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 PLD4Q96BZ4 506 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 NANOGQ9H9S0 305 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 H7C0S8 307 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ESR1P03372 595 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 GNAO1P09471 354 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CASP2P42575 452 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 EMX2Q04743 252 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 TIGD2Q4W5G0 525 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ANKS3Q6ZW76 656 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF786Q8N393 782 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 TTC30BQ8N4P2 665 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CDYL2Q8N8U2 506 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 PDZD8Q8NEN9 1154 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ESAMQ96AP7 390 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 GJB5O95377 273 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 NCK1P16333 377 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CDH15P55291 814 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ZFAND4Q86XD8 727 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 STK40Q8N2I9 435 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 GLT1D1Q96MS3 346 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CASD1Q96PB1 797 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 BPIFA1Q9NP55 256 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1B0GVM2 712 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 IL12AP29459 219 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ESRRGP62508 458 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 PRKG2Q13237 762 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 TGFBIQ15582 683 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 PRR23BQ6ZRT6 265 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM74Q96NL1 305 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ASB1Q9Y576 335 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ERVPABLB-1P60509 514 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 FXNQ16595 210 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 HECTD3Q5T447 861 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 TAS2R42Q7RTR8 314 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 HID1Q8IV36 788 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 DPP10Q8N608 796 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 PROKR1Q8TCW9 393 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 OVCA2Q8WZ82 227 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 HEBP1Q9NRV9 189 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ELNP15502 786 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 SGSHP51688 502 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 TRAF2Q12933 501 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZSR9 355 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 OSCP1Q8WVF1 389 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CYGBQ8WWM9 190 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CEP295NLQ96MC4 621 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC3Q9BY71 257 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 CWH43Q9H720 699 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 SLAMF8Q9P0V8 285 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM64A6NGJ6 449 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 LDLRP01130 860 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 GPR141Q7Z602 305 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 OR52B6Q8NGF0 335 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 BIRC7Q96CA5 298 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 TTPALQ9BTX7 342 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 MUC3BQ9H195 1237 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 HSFX1Q9UBD0 423 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 EI24O14681 340 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 SNAP91O60641 907 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 GATMP50440 423 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 CLCN7P51798 805 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 NCEH1Q6PIU2 408 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 FRA10AC1Q70Z53 315 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 DHRSXQ8N5I4 330 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 P2RY12Q9H244 342 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXD13-201ENST00000392539 DHRS7Q9Y394 339 aa26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms