RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 ASB8Q9H765 288 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PISDQ9UG56 409 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 AGAP14A8MT82 685 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PSMD3O43242 534 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 LDB2O43679 373 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 VCLP18206 1134 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ITIH1P19827 911 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 HADHAP40939 763 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CTSCP53634 463 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 EPHA4P54764 986 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PDP2Q9P2J9 529 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNA1GO43497 2377 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 DUX1O43812 170 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 AP2A1O95782 977 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 THRAP10827 490 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 BRAFP15056 766 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 IDSP22304 550 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC5A2P31639 672 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC19A1P41440 591 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 DMPKQ09013 629 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 AMZ2Q86W34 360 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM58Q8NG06 486 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PRORYQ9H606 182 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 UCK1Q9HA47 277 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 LILRA5A6NI73 299 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 AGRPO00253 132 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 KLK10O43240 276 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 NRDCO43847 1150 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 MSH3P20585 1137 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ETV5P41161 510 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.24■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 OR2AG2A6NM03 316 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 VIPP01282 170 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 MPSTP25325 297 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 LINC00523Q86TU6 105 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 JAMLQ86YT9 394 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TLR10Q9BXR5 811 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.23■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 H7C0S8 307 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TPH1P17752 444 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 AKT1P31749 480 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 MAPK10P53779 464 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TMPRSS15P98073 1019 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CLCA4Q14CN2 919 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 BROXQ5VW32 411 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SNX20Q7Z614 316 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM48Q8IWZ4 208 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 AGBL5Q8NDL9 886 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 NCSTNQ92542 709 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ULK4Q96C45 1275 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SGF29Q96ES7 293 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 POT1Q9NUX5 634 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.22■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 OR52A4PA6NMU1 304 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 IFNB1P01574 187 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CCL4P13236 92 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGALP20701 1170 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 FDFT1P37268 417 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 UCNP55089 124 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CLN3Q13286 438 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 SNX1Q13596 522 aa20.21■□□□□ 0.83
UBE2E3-201ENST00000392415 CCNG2Q16589 344 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms