RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391071.1

RNA5SP171-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 171, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP171, Length 115 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP171-201ENST00000391071 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 POT1Q9NUX5 634 aa3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 VANGL2Q9ULK5 521 aa3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 KCNK6Q9Y257 313 aa3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 SNX10Q9Y5X0 201 aa3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 LYSTQ99698 3801 aa3.64□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 HERC1Q15751 4861 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 PLCE1Q9P212 2302 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 A8MX80 341 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 C9J4A7 227 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 I6L893 689 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 CPLX1O14810 134 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZNF749O43361 778 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 TCF21O43680 179 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 CDC45O75419 566 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 PIGNO95427 931 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ADCY5O95622 1261 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 SOD1P00441 154 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 CTSBP07858 339 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 RHOCP08134 193 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 F3P13726 295 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 MMP11P24347 488 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 HSD11B2P80365 405 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 NUCB1Q02818 461 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 COL10A1Q03692 680 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 NCOA4Q13772 614 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 MCM6Q14566 821 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 PSMD6Q15008 389 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 PLCL1Q15111 1095 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 SURF1Q15526 300 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 UGP2Q16851 508 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 C5orf22Q49AR2 442 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 AWAT1Q58HT5 328 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 CYB5D1Q6P9G0 228 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ABHD17CQ6PCB6 329 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 LIPIQ6XZB0 460 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 PAQR7Q86WK9 346 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 SMC5Q8IY18 1101 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 PLPP6Q8IY26 295 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 EID3Q8N140 333 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ANKRD52Q8NB46 1076 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 OR2AP1Q8NGE2 309 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 UBA3Q8TBC4 463 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 UBXN4Q92575 508 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ACCSQ96QU6 501 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 PIGQQ9BRB3 760 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 SPON2Q9BUD6 331 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZNF747Q9BV97 191 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 SARGQ9BW04 601 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 NT5C1AQ9BXI3 368 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 RAB33BQ9H082 229 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 UCK1Q9HA47 277 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 LRRC4Q9HBW1 653 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 KLHL1Q9NR64 748 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 GNPTGQ9UJJ9 305 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.63□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 PLXNB1O43157 2135 aa3.62□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 OR5H15A6NDH6 313 aa3.62□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 TMEM150CB9EJG8 249 aa3.62□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 H3BMH7 237 aa3.62□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 MAPK13O15264 365 aa3.62□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 HCRTR1O43613 425 aa3.62□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 CLDN11O75508 207 aa3.62□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ONECUT2O95948 504 aa3.62□□□□□ -1.83
RNA5SP171-201ENST00000391071 ASS1P00966 412 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms