RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 CAPSQ13938 189 aa7.38□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 CLCA4Q14CN2 919 aa7.38□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 FAM187BQ17R55 369 aa7.38□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.38□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.38□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.38□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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GABPB2-201ENST00000368916 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.38□□□□□ -1.23
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GABPB2-201ENST00000368916 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.38□□□□□ -1.23
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GABPB2-201ENST00000368916 METTL4Q8N3J2 472 aa7.37□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 Q8N3U1 123 aa7.37□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 TTLL6Q8N841 843 aa7.37□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 DNERQ8NFT8 737 aa7.37□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.37□□□□□ -1.23
GABPB2-201ENST00000368916 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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