RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ITPKBP27987 946 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GDF10P55107 478 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFA5Q16718 116 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 BANPQ8N9N5 519 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CAPNS2Q96L46 248 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FCRL5Q96RD9 977 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GPIP06744 558 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNGP07510 517 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 MTHFRP42898 656 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PRMT2P55345 433 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SH3GLB1Q9Y371 365 aa20.08■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GABRDO14764 452 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 WASP42768 502 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CA9Q16790 459 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 HMGXB4Q9UGU5 601 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 LAMP2P13473 410 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.08■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 KERAO60938 352 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CAP1Q01518 475 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ABLIM1O14639 778 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 OR4F21O95013 312 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RTL4Q6ZR62 310 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PIK3C3Q8NEB9 887 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PGRMC2O15173 223 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SCELO95171 688 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 C8AP07357 584 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ROPN1LQ96C74 230 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL31Q9H511 634 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ALG2Q9H553 416 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 MCIDASD6RGH6 385 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CA12O43570 354 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 C8GP07360 202 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PERM1Q5SV97 790 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 EQTNQ9NQ60 294 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.07■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM63AO94886 807 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FAM163BP0C2L3 166 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK12P53778 367 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FAM171BQ6P995 826 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SLC34A3Q8N130 599 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL18Q96ME1 805 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2QL1A1L167 161 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 IFNW1P05000 195 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 IGFBP5P24593 272 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB6Q15916 424 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFA9Q16795 377 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 RPTNQ6XPR3 784 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 THAP5Q7Z6K1 395 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ARL10Q8N8L6 244 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF516Q92618 1163 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.06■□□□□ 0.8
CCSAP-203ENST00000366687 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms