RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 PLA2G4FQ68DD2 849 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ACSM6Q6P461 480 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PAQR3Q6TCH7 311 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RNF207Q6ZRF8 634 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DOK3Q7L591 496 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF595Q8IYB9 648 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TTC9BQ8N6N2 239 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00482Q8N8I6 264 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP61Q8NHU2 1237 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GPT2Q8TD30 523 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SGCDQ92629 289 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 OSBPL10Q9BXB5 764 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM206Q9H813 350 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ABCB8Q9NUT2 735 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1456Q9P272 454 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 AMACRQ9UHK6 382 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ANAPC5Q9UJX4 755 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LOC100509620A0A075B734 347 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0G2JNJ9 132 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PRR19A6NJB7 356 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SDR42E2A6NKP2 422 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CELF2O95319 508 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ETS1P14921 441 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LRPAP1P30533 357 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NUMBP49757 651 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MTHFSP49914 203 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RAB28P51157 221 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 STAT5BP51692 787 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GNAI1P63096 354 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SCN1BQ07699 218 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM62Q0P6H9 643 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PDZK1IP1Q13113 114 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RIPK1Q13546 671 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 STIM1Q13586 685 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KRT24Q2M2I5 525 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HS1BP3Q53T59 392 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GRHL2Q6ISB3 625 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT18Q6P9A2 607 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CES3Q6UWW8 571 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 G2E3Q7L622 706 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CAMKMTQ7Z624 323 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NEK8Q86SG6 692 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC10AQ8IUN9 316 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PEX5LQ8IYB4 626 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MTURNQ8N3F0 131 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CADM4Q8NFZ8 388 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 OR2T3Q8NH03 318 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ACMSDQ8TDX5 336 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TAS1R2Q8TE23 839 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPDL1Q96EA4 605 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PSKH2Q96QS6 385 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NTMT1Q9BV86 223 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC2Q9BYS8 371 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TRPV6Q9H1D0 765 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 COQ10BQ9H8M1 238 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KLC4Q9NSK0 619 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 IFNKQ9P0W0 207 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 Q9UFV3 132 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 BAG5Q9UL15 447 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 POMT1Q9Y6A1 747 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DOCK1Q14185 1865 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 YDJCA8MPS7 323 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PEX12O00623 359 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CEACAM5P06731 702 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KRT19P08727 400 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MCF2P10911 925 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PRKCAP17252 672 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SYT1P21579 422 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RPS6KA3P51812 740 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 STAT2P52630 851 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PTENP60484 403 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DMTNQ08495 405 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NFYCQ13952 458 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LPIN1Q14693 890 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GAGE13Q4V321 117 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM63BQ5T3F8 832 aa2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms