RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 C19orf48Q6RUI8 117 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 C4orf50Q6ZRC1 276 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPRG1Q6ZUI0 275 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEX11Q8IYF3 940 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC8CQ8TDW0 803 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 UHRF2Q96PU4 802 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDCD1Q96RS6 583 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 EPYCQ99645 322 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAD21L1Q9H4I0 556 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 FSD2A1L4K1 749 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2M5A3KFT3 312 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR23AA6NEV1 266 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 AGAP14A8MT82 685 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANKRD66B4E2M5 251 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLK4O00444 970 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 DVL1O14640 695 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC01565O15544 149 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZBTB43O43298 467 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYNGR3O43761 229 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTSVO60911 334 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMCC2O75069 709 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 BAG4O95429 457 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TUBBP07437 444 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSF2RAP15509 400 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF23P17027 643 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 MCCP23508 829 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 MT3P25713 68 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIMP3P35625 211 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSMB10P40306 273 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 SUOXP51687 545 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TERF1P54274 439 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 DRG2P55039 364 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHEXP78562 749 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP2R2BQ00005 443 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 GAGE5Q13069 117 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 GAGE6Q13070 117 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBE2V1Q13404 147 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 DLG2Q15700 870 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 MEP1AQ16819 746 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM205BPQ63HN1 556 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF534Q76KX8 674 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC26A9Q7LBE3 791 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 GALNT13Q8IUC8 556 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCYL3Q8IZE3 742 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHDC9Q8NEP7 349 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PGLYRP2Q96PD5 576 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDOQ99489 341 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 HGH1Q9BTY7 390 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 GHITMQ9H3K2 345 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYNCQ9H7C4 482 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRPC7Q9HCX4 862 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBC1D22BQ9NU19 505 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0G2JNG1 304 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 A6NCN8 305 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 BUD23O43709 281 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT86O43790 486 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 MITFO75030 526 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 GJB3O75712 270 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDE9AO76083 593 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 GCNT3O95395 438 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TFAP2AP05549 437 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT19P08727 400 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANOS1P23352 680 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 NR2F2P24468 414 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXD13P35453 343 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCTP40126 519 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 EIF5P55010 431 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 MC1RQ01726 317 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 CREB5Q02930 508 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBTD1Q05BQ5 628 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACVR2BQ13705 512 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT81Q14533 505 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIR2DS5Q14953 304 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms