RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 WASH4PA8MWX3 477 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHGA12O60330 932 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RAMP2O60895 175 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KCNJ13O60928 360 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RAB36O95755 333 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 STAU1O95793 577 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PRLP01236 227 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PROCP04070 461 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ELK3P41970 407 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 BRCC3P46736 316 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GSSP48637 474 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LCP2Q13094 533 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MTF1Q14872 753 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 VMACQ2NL98 169 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OXER1Q8TDS5 423 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HYLS1Q96M11 299 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C19orf43Q9BQ61 176 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MUC3BQ9H195 1237 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 INPP5EQ9NRR6 644 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TTC3P53804 2025 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IRAK2O43187 625 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PAX7P23759 505 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HTR2AP28223 471 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ECI1P42126 302 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NOMO3P69849 1222 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NOMO1Q15155 1222 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 IL31RAQ8NI17 732 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 GON7Q9BXV9 100 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC7A4O43246 635 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 RGS1Q08116 209 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DSELQ8IZU8 1212 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KIF2BQ8N4N8 673 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 H7C2Y5 167 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FABP3P05413 133 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 BGNP21810 368 aa4.87□□□□□ -1.63
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