RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHX3Q9H6B9 360 aa27.06■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 POM121BA6NF01 834 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 TOR1BO14657 336 aa27.06■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CA5BQ9Y2D0 317 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 A6NNZ2 444 aa27.05■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR89BP0CG08 455 aa27.05■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35E2BP0CK96 405 aa27.05■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 YPEL5P62699 121 aa27.05■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf74Q86VG3 221 aa27.05■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TDGF1P13385 188 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD27P26842 260 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGGT1BP53609 377 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTLL9Q3SXZ7 439 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCNT7Q6ZNI0 430 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 BANPQ8N9N5 519 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM145Q8NBT3 493 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 INPP5DQ92835 1189 aa27.04■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM53CQ9NYF3 392 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHRS7Q9Y394 339 aa27.04■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLRA3O75311 464 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL6A2P12110 1019 aa27.03■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 THOP1P52888 689 aa27.03■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA1024LP59773 190 aa27.03■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM174AQ8TBP5 190 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCM2Q9BSQ5 444 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR34Q9UPC5 381 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED16Q9Y2X0 877 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 BDP1A6H8Y1 2624 aa27.03■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CRHR1P34998 444 aa27.02■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEFF1Q8IYR6 380 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB2Q8N680 514 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD200R1Q8TD46 325 aa27.02■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL42Q9P2K6 505 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALPQ9UBC7 116 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOSPD1Q9UJG1 213 aa27.02■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM120BA0PK00 339 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 SGTAO43765 313 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUAK1O60285 661 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJC6O75061 913 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC166P0CW27 439 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSRP3P50461 194 aa27.01■■□□□ 1.91
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