RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 ACTR1AP61163 376 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP8P85298 464 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CTBP1Q13363 440 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ELOCQ15369 112 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TEX35Q5T0J7 233 aa8.96□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.96□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 C9orf72Q96LT7 481 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.96□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 U3KQA8 63 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SSTR1P30872 391 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GRK6P43250 576 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJC3Q13217 504 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NFE2L1Q14494 772 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 LONRF1Q17RB8 773 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NEPROQ6NW34 567 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 OR4C6Q8NH72 309 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 KLC4Q9NSK0 619 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 TAAR2Q9P1P5 351 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 B4DGG1 531 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 MPP1Q00013 466 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CBLBQ13191 982 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GTF2H3Q13889 308 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 INSCQ1MX18 579 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 STEAP4Q687X5 459 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 KCNMB4Q86W47 210 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NAGSQ8N159 534 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 KYQ8NBH2 561 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 FAM136AQ96C01 138 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 LRRC39Q96DD0 335 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 APOLD1Q96LR9 279 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 RMI1Q9H9A7 625 aa8.95□□□□□ -0.98
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PDE4D-201ENST00000309641 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NFU1Q9UMS0 254 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GPR34Q9UPC5 381 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 RP1P56715 2156 aa8.95□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NEMP2A6NFY4 417 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 GPR89AB7ZAQ6 455 aa8.94□□□□□ -0.98
PDE4D-201ENST00000309641 NOBOXO60393 691 aa8.94□□□□□ -0.98
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