RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf21Q9H246 121 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SARDHQ9UL12 918 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.47■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PIK3R1P27986 724 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 ETV3P41162 512 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PPP1R3AQ16821 1122 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 KCNA7Q96RP8 456 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SZT2Q5T011 3432 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 GM2AP17900 193 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 METAP1P53582 386 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 INHBCP55103 352 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 HYAL1Q12794 435 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 RALGDSQ12967 914 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 LCP2Q13094 533 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 RAB30Q15771 203 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 FAM83DQ9H4H8 585 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 OBP2AQ9NY56 170 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 PCTPQ9UKL6 214 aa22.46■■□□□ 1.19
VSTM4-201ENST00000298454 FGF4P08620 206 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DGKAP23743 735 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PRDX6P30041 224 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 RGS4P49798 205 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 MNAT1P51948 309 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DET1Q7L5Y6 550 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 MYO1HQ8N1T3 1032 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 AGAP11Q8TF27 550 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ULK4Q96C45 1275 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 THTPAQ9BU02 230 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP14Q9HCL3 533 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DKK3Q9UBP4 350 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ITM2BQ9Y287 266 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ANTXRLA6NF34 631 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6AP2O75787 350 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 GRM2Q14416 872 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PDGFRLQ15198 375 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PELI3Q8N2H9 469 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CLPTM1LQ96KA5 538 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 C3orf30Q96M34 536 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CDH7Q9ULB5 785 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.45■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 AZIN1O14977 448 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 MTX2O75431 263 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 GRIN2CQ14957 1233 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 DPPA4Q7L190 304 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 C19orf60Q96EN9 201 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa22.44■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 E2F3O00716 465 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ENTPD5O75356 428 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CUL3Q13618 768 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 KANK2Q63ZY3 851 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TMCO1Q9UM00 188 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEC1O60732 1142 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CCR7P32248 378 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF234Q14588 700 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CHSY3Q70JA7 882 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 SNX32Q86XE0 403 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TERB1Q8NA31 727 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 FAM161BQ96MY7 647 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 HGH1Q9BTY7 390 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 CD248Q9HCU0 757 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.43■■□□□ 1.18
VSTM4-201ENST00000298454 FFAR2O15552 330 aa22.42■■□□□ 1.18
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