RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 TRIB3Q96RU7 358 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CIPCQ9C0C6 399 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 VPS28Q9UK41 221 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PCTPQ9UKL6 214 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MYO9BQ13459 2157 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ACSL4O60488 711 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 KCNH1O95259 989 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CLDN7O95471 211 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 H6PDO95479 791 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 STAMBPO95630 424 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ALDH2P05091 517 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CDK4P11802 303 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SLC2A4P14672 509 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 IL7RP16871 459 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FSHRP23945 695 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 HRH2P25021 359 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 STK19P49842 368 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 KCNK10P57789 538 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TAF12Q16514 161 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 IMPG1Q17R60 797 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TMEM26Q6ZUK4 368 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CARM1Q86X55 608 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ZNF597Q96LX8 424 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 EGFL8Q99944 293 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 H3BNC9 293 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 AP3B1O00203 1094 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 AGRPO00253 132 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TBL1XO60907 577 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SLC22A3O75751 556 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FGF1P05230 155 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TYMPP19971 482 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 HTRA3P83110 453 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PMS2P3Q13401 168 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 TGFBIQ15582 683 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 NKG7Q16617 165 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CD99L2Q8TCZ2 262 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 BIRC7Q96CA5 298 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ADI1Q9BV57 179 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.56□□□□□ -1.04
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GINS1-201ENST00000262460 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 E2F3O00716 465 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 STC2O76061 302 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ENTPD1P49961 510 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PSMD7P51665 324 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 RPS6KA3P51812 740 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 APOFQ13790 326 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 OR10A6Q8NH74 314 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 KIAA1191Q96A73 305 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CCDC126Q96EE4 140 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 C8orf48Q96LL4 319 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 CHID1Q9BWS9 393 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ACTL8Q9H568 366 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ETAA1Q9NY74 926 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 VAPAQ9P0L0 249 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 KLQ9UEF7 1012 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS1-201ENST00000262460 ANKRD36A6QL64 1941 aa8.56□□□□□ -1.04
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