RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 BPIP17213 487 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 ITGALP20701 1170 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 MAGEA11P43364 429 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 SLC6A11P48066 632 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CCNG1P51959 295 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 LAPTM5Q13571 262 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 IL23RQ5VWK5 629 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM151AQ8N4L1 468 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM199Q8N511 208 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 FBXO30Q8TB52 745 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 FIG4Q92562 907 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 LPGAT1Q92604 370 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 KDELR3O43731 214 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 TGDSO95455 350 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CD160O95971 181 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 SERPINA4P29622 427 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 GTDC1Q4AE62 458 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 SYVN1Q86TM6 617 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 VRK3Q8IV63 474 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 SUN2Q9UH99 717 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 MID2Q9UJV3 735 aa8.99□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 NOTCH4Q99466 2003 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 DPPA5A6NC42 116 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF195O14628 629 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 DIRAS1O95057 198 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 IGSF6O95976 241 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 NNMTP40261 264 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 HK3P52790 923 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CCNIQ14094 377 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 TGFBIQ15582 683 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CCSMST1Q4G0I0 132 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 RPAINQ86UA6 219 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 PLD3Q8IV08 490 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 VPS50Q96JG6 964 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 MAGED4Q96JG8 741 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 TDP1Q9NUW8 608 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 EXD2Q9NVH0 621 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CEP250Q9BV73 2442 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 H3BNC9 293 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 SH3BP5O60239 455 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CHEK2O96017 543 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 C1QCP02747 245 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CEBPBP17676 345 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 MAPKAPK2P49137 400 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 IST1P53990 364 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CLEC14AQ86T13 490 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 PELI3Q8N2H9 469 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 PHC3Q8NDX5 983 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CYGBQ8WWM9 190 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 CNDP1Q96KN2 507 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 IL17FQ96PD4 163 aa8.98□□□□□ -0.97
CKAP2-201ENST00000258607 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms