RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.62□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.62□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.62□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 TRPV1Q8NER1 839 aa14.62□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.62□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.62□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.62□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 PTGESO14684 152 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ANXA9O76027 345 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 NPR3P17342 541 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 TTC23Q5W5X9 447 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SPESP1Q6UW49 350 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 FIG4Q92562 907 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 DACH2Q96NX9 599 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 MARCH7Q9H992 704 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 INVSQ9Y283 1065 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 DLGAP3O95886 979 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CHRNB3Q05901 458 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 DGUOKQ16854 277 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 AKAP14Q86UN6 197 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 TTC16Q8NEE8 873 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 FRS2Q8WU20 508 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 MBOAT4Q96T53 435 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ACOX2Q99424 681 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CGREF1Q99674 301 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 U3KQV3 271 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SCN4AP35499 1836 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 PSMD3O43242 534 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 HS6ST1O60243 411 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 MATN4O95460 622 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SEC24AO95486 1093 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CYBBP04839 570 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CDH1P12830 882 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 PSMB9P28065 219 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CLCN5P51795 746 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 IFITM2Q01629 132 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CLEC20AQ6ZU45 233 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 BNIPLQ7Z465 357 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 RMND5AQ9H871 391 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 GABRQQ9UN88 632 aa14.61□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SLC1A7O00341 560 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SLC22A3O75751 556 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 DNAJB2P25686 324 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CLCNKBP51801 687 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 IL1RL1Q01638 556 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 OR4D1Q15615 310 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 C17orf99Q6UX52 265 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 IFNL1Q8IU54 200 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ESAMQ96AP7 390 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 VMP1Q96GC9 406 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 SNPHO15079 494 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CST1P01037 141 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CD4P01730 458 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 HLA-DQB2P05538 268 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 ARSDP51689 593 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 IL5RAQ01344 420 aa14.6□□□□□ -0.07
MSI1-201ENST00000257552 FOXM1Q08050 763 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms