RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 ADRA1AP35348 466 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CHRNA4P43681 627 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 ZNF789Q5FWF6 425 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 FGD3Q5JSP0 725 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 C16orf87Q6PH81 154 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 TRPV3Q8NET8 790 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 PKD2L2Q9NZM6 624 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 F11P03951 625 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 OCM2P0CE71 109 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 UGT1A1P22309 533 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 UGT1A4P22310 534 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 UGT1A3P35503 534 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 UGT1A5P35504 534 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 IHHQ14623 411 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 PCSK7Q16549 785 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 ZNF678Q5SXM1 525 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 MARC1Q5VT66 337 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 XKR5Q6UX68 686 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 LRRC49Q8IUZ0 686 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 HS6ST3Q8IZP7 471 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CLYBLQ8N0X4 340 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 L3HYPDHQ96EM0 354 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 ALG9Q9H6U8 611 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 IL21Q9HBE4 155 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CMTM6Q9NX76 183 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 COQ6Q9Y2Z9 468 aa19.99■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CHD9Q3L8U1 2897 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 HIDE1A8MVS5 230 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 ACOX3O15254 700 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 GFAPP14136 432 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 GJA1P17302 382 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CAPN3P20807 821 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 HECTD2Q5U5R9 776 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 DDIASQ8IXT1 998 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 UBXN10Q96LJ8 280 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 TCF25Q9BQ70 676 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 TMEM9Q9P0T7 183 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 RENBPP51606 427 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 PSMD7P51665 324 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CYP4F8P98187 520 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 SERINC3Q13530 473 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CYP51A1Q16850 503 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 OR7D4Q8NG98 312 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 ANKRD49Q8WVL7 239 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 MCOLN1Q9GZU1 580 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa19.98■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 DYTNA2CJ06 578 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 TLL1O43897 1013 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CD247P20963 164 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CCR3P51677 355 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 BNIP3Q12983 259 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 NEDD8Q15843 81 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 MOGQ16653 247 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 GEN1Q17RS7 908 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 UNC50Q53HI1 259 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 DCDC5Q6ZRR9 648 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 GAREM2Q75VX8 874 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 TMEM221A6NGB7 291 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 FXYD1O00168 92 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 INPP4BO15327 924 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 INHBBP09529 407 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 SLC6A2P23975 617 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 GABRR2P28476 465 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 RPS9P46781 194 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 DSC2Q02487 901 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 TGFBIQ15582 683 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 SLC14A2Q15849 920 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 GRAMD4Q6IC98 578 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 PGBD5Q8N414 524 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 PLD4Q96BZ4 506 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 LRRC58Q96CX6 371 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 MRGPRX2Q96LB1 330 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 TUBA1CQ9BQE3 449 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa19.97■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 H3BNC9 293 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 RELAQ04206 551 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 FOXM1Q08050 763 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 UGT3A2Q3SY77 523 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 SPATS1Q496A3 300 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 RAD9AQ99638 391 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 CCDC68Q9H2F9 335 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 MUC13Q9H3R2 512 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 PFDN4Q9NQP4 134 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 GIMAP2Q9UG22 337 aa19.96■□□□□ 0.79
VGF-201ENST00000249330 VWA7Q9Y334 891 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms