RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216484.6

SPTLC2-201, Transcript of serine palmitoyltransferase long chain base subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPTLC2, Length 8,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2-201ENST00000216484 VAT1Q99536 393 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TMEM51Q9NW97 253 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SQORQ9Y6N5 450 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ITGA5P08648 1049 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SPARCP09486 303 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 UROSP10746 265 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 CORO1BQ9BR76 489 aa14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 GNB3P16520 340 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF3P17036 446 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC1A2P43004 574 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 KLHL35Q6PF15 583 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBX5Q99593 518 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TOR1BO14657 336 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBX1O43435 398 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 VAMP1P23763 118 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TUBA1BP68363 451 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC6A3Q01959 620 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 C2orf80Q0P641 193 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 BATFQ16520 125 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TUBA1AQ71U36 451 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 C17orf64Q86WR6 236 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 OR2T12Q8NG77 320 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 CXCR3P49682 368 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ECT2LQ008S8 904 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ST3GAL4Q11206 333 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TMEM110Q86TL2 294 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM35AQ86V20 835 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ABI3Q9P2A4 366 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 A0A0A0MRY4 1105 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ACSL1P33121 698 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF550Q7Z398 422 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 FAM110BQ8TC76 370 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ATG4CQ96DT6 458 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SPATA13Q96N96 652 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ADGRL2O95490 1459 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 KNTC1P50748 2209 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 PIAS1O75925 651 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SLC20A2Q08357 652 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 GIT2Q14161 759 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 KCNK18Q7Z418 384 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 DEFB106AQ8N104 65 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 RAB26Q9ULW5 256 aa14.49□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF609O15014 1411 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 E5RJQ4 531 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 FUT4P22083 530 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 H3BSH0 61 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 HSPA12AO43301 675 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 INMTO95050 263 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 HSPB3Q12988 150 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 LY6KQ17RY6 165 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TTI2Q6NXR4 508 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 CEP68Q76N32 757 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 APOC2P02655 101 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 SOX10P56693 466 aa14.48□□□□□ -0.09
SPTLC2-201ENST00000216484 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.2 ms