RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 SLC1A7O00341 560 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 CNMDO75829 334 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 GABARAPO95166 117 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ITIH1P19827 911 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 LILRA4P59901 499 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 VBP1P61758 197 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 EMX2Q04743 252 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 OR2T11Q8NH01 316 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 PPM1MQ96MI6 270 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ERVK-11Q9UQG0 969 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 OTOFQ9HC10 1997 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 XPNPEP2O43895 674 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 PRR35P0CG20 571 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 GABARAPL2P60520 117 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 MOB2Q70IA6 237 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 MINDY2Q8NBR6 621 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 CALML6Q8TD86 181 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 FAR1Q8WVX9 515 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 LRRC3Q9BY71 257 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 MATN3O15232 486 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 IHHQ14623 411 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ARMCX2Q7L311 632 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 PROSER1Q86XN7 944 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ITFG1Q8TB96 612 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 RNF34Q969K3 372 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ITCHQ96J02 903 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 NODALQ96S42 347 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 FBXO10Q9UK96 956 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.31■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 G3V2T6 193 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 GMNNO75496 209 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 SLC22A3O75751 556 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 PLIN5Q00G26 463 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 SLC13A2Q13183 592 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 AAK1Q2M2I8 961 aa20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 KDELC1Q6UW63 502 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ARL10Q8N8L6 244 aa20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 C17orf50Q8WW18 174 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 S100ZQ8WXG8 99 aa20.3■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 GLMNQ92990 594 aa20.3■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 MAP2K4P45985 399 aa20.29■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 PPP2R2BQ00005 443 aa20.29■□□□□ 0.84
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PMS1-222ENST00000639501 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.29■□□□□ 0.84
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