RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DHFR2	Q86XF0	187 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DENND1C	Q8IV53	801 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SFRP1	Q8N474	314 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RNF148	Q8N7C7	305 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SH3GL1	Q99961	368 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RNF38	Q9H0F5	515 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SP140L	Q9H930	580 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GKN1	Q9NS71	199 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NUAK1	O60285	661 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	JRK	O75564	520 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RASAL1	O95294	804 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00271	P0C7V0	271 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IL10	P22301	178 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB1	P25685	340 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CA8	P35219	290 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FPGS	Q05932	587 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IL10RB	Q08334	325 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SERINC3	Q13530	473 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MARC1	Q5VT66	337 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CES3	Q6UWW8	571 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM135	Q86UB9	458 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IPMK	Q8NFU5	416 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	BAD	Q92934	168 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CD300A	Q9UGN4	299 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	INSL6	Q9Y581	213 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ILVBL	A1L0T0	632 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf78	A6NCI8	922 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659		G3V2L1	256 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659		H0YAE9	185 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CHEK2	O96017	543 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	F11	P03951	625 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TPH1	P17752	444 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINB1	P30740	379 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HADHA	P40939	763 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TNK2	Q07912	1038 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ATP6AP1	Q15904	470 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LIPM	Q5VYY2	423 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SPRED1	Q7Z699	444 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CBR4	Q8N4T8	237 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TEX26	Q8N6G2	289 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FICD	Q9BVA6	458 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NT5M	Q9NPB1	228 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OXSM	Q9NWU1	459 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SATB2	Q9UPW6	733 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAM172BP	A6NC97	362 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DLGAP1	O14490	977 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KLKB1	P03952	638 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IRF1	P10914	325 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAS	P25445	335 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ADRA1A	P35348	466 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IDUA	P35475	653 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ACVRL1	P37023	503 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINB10	P48595	397 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TRPC1	P48995	793 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CDH4	P55283	916 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CD300C	Q08708	224 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SELENBP1	Q13228	472 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AKAP14	Q86UN6	197 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ELMOD1	Q8N336	334 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CERS2	Q96G23	380 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms