RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 VASH2Q86V25 355 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 TP53INP2Q8IXH6 220 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF567Q8N184 647 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 MAML1Q92585 1016 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC39Q96DD0 335 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 TEKT5Q96M29 485 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR92Q96MX6 357 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PDFQ9HBH1 243 aa23.99■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 KLQ9UEF7 1012 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf172C9J069 976 aa23.98■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 FAM87AP0C7U9 286 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 LIG3P49916 1009 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD22Q5VYY1 191 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PID1Q7Z2X4 250 aa23.98■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SUV39H2Q9H5I1 410 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF215Q9Y6U7 377 aa23.98■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMD3O43242 534 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SUV39H1O43463 412 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM63AO94886 807 aa23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 MTM1Q13496 603 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC29A2Q14542 456 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC25Q86WR0 208 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.97■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL4L1Q8NHW4 92 aa23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 PNLIPP16233 465 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 RGRP47804 291 aa23.96■■□□□ 1.43
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 PELI3Q8N2H9 469 aa23.96■■□□□ 1.43
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CAPNS1-216ENST00000628306 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8KD6RF30 607 aa23.95■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1024LP59773 190 aa23.95■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 NSMCE3Q96MG7 304 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM168Q9H0V1 697 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA6CQ9H3T2 930 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 SAYSD1Q9NPB0 183 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR70Q9NW82 654 aa23.95■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 NINJ2Q9NZG7 142 aa23.95■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 C14orf28Q4W4Y0 310 aa23.94■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
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CAPNS1-216ENST00000628306 LGR4Q9BXB1 951 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 GBA3Q9H227 469 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 PPCSQ9HAB8 311 aa23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 E7EVH7 732 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 B4GAT1O43505 415 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 JCHAINP01591 159 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 XPAP23025 273 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM23P36406 574 aa23.93■■□□□ 1.42
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF844Q08AG5 666 aa23.93■■□□□ 1.42
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