RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615065.1

PRKN-211, Transcript of parkin RBR E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRKN, Length 261 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKN-211ENST00000615065 KRT35Q92764 455 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 VPS35Q96QK1 796 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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PRKN-211ENST00000615065 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.6□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.6□□□□□ -0.07
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PRKN-211ENST00000615065 GPR39O43194 453 aa14.59□□□□□ -0.07
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PRKN-211ENST00000615065 CDK14O94921 469 aa14.59□□□□□ -0.07
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PRKN-211ENST00000615065 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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PRKN-211ENST00000615065 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.59□□□□□ -0.07
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PRKN-211ENST00000615065 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.59□□□□□ -0.07
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PRKN-211ENST00000615065 IL26Q9NPH9 171 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.59□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PRKN-211ENST00000615065 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa14.59□□□□□ -0.07
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PRKN-211ENST00000615065 J3QKU1 62 aa14.58□□□□□ -0.08
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PRKN-211ENST00000615065 RAD1O60671 282 aa14.58□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 VIPP01282 170 aa14.58□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 EPOP01588 193 aa14.58□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 FAM87AP0C7U9 286 aa14.58□□□□□ -0.08
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PRKN-211ENST00000615065 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 SLC1A5Q15758 541 aa14.58□□□□□ -0.08
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PRKN-211ENST00000615065 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.58□□□□□ -0.08
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PRKN-211ENST00000615065 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.57□□□□□ -0.08
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PRKN-211ENST00000615065 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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PRKN-211ENST00000615065 PPP2R5EQ16537 467 aa14.57□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.57□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.57□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 BBS12Q6ZW61 710 aa14.57□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 DAAM2Q86T65 1068 aa14.57□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.57□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 SPRY4Q9C004 299 aa14.57□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.57□□□□□ -0.08
PRKN-211ENST00000615065 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.57□□□□□ -0.08
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