RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602479.5

UBE2E3-206, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E3, Length 752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-206ENST00000602479 MTSS1O43312 755 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 MAGEA1P43355 309 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 WNT3AP56704 352 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 MC2RQ01718 297 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 SIRPB2Q5JXA9 342 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 SARM1Q6SZW1 724 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 XKR5Q6UX68 686 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 P3H4Q92791 437 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 RTP4Q96DX8 246 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.024e-9■■■■□ 25.4
UBE2E3-206ENST00000602479 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 OGFRQ9NZT2 677 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 PILRAQ9UKJ1 303 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 TFR2Q9UP52 801 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2E3-206ENST00000602479 J3QKU1 62 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 LIFP15018 202 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 CHRNA4P43681 627 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 TBR1Q16650 682 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 C11orf63Q6NUN7 778 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 C11orf96Q7Z7L8 435 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 ZNF567Q8N184 647 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 IL22RA1Q8N6P7 574 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 HAUS1Q96CS2 278 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 MRGPRX2Q96LB1 330 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 SPRY4Q9C004 299 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 TRABDQ9H4I3 376 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 FBXO8Q9NRD0 319 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 KLHL3Q9UH77 587 aa21.39■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 FLNCQ14315 2725 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 F5H423 210 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 RAD1O60671 282 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 CDK14O94921 469 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 EPOP01588 193 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 ANKRD34CP0C6C1 535 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 FAM87AP0C7U9 286 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 BRAFP15056 766 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 SLC19A1P41440 591 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 GFERP55789 205 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 FCRL5Q96RD9 977 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 VAT1Q99536 393 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 CTRCQ99895 268 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 APMAPQ9HDC9 416 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 IL26Q9NPH9 171 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 VIPP01282 170 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 C9P02748 559 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 CEACAM20Q6UY09 585 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 BBS12Q6ZW61 710 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 PLXDC1Q8IUK5 500 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 TRIM48Q8IWZ4 208 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 RCOR2Q8IZ40 523 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 DTX3LQ8TDB6 740 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 KRT35Q92764 455 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 ZPBPQ9BS86 351 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 HACD3Q9P035 362 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 IL17CQ9P0M4 197 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 HACD1B0YJ81 288 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 GPR39O43194 453 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 UBXN7O94888 489 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 ITGB6P18564 788 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 RPL10P27635 214 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 NFATC3Q12968 1075 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 SLC1A5Q15758 541 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 PPP2R5EQ16537 467 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 AGAP9Q5VTM2 703 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 WASH2PQ6VEQ5 465 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 PID1Q7Z2X4 250 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 CCDC170Q8IYT3 715 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 IPMKQ8NFU5 416 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 GDAP1Q8TB36 358 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 C9orf72Q96LT7 481 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 TRIM5Q9C035 493 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 WASH6PQ9NQA3 447 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 STARD5Q9NSY2 213 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 POT1Q9NUX5 634 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-206ENST00000602479 OR52A4PA6NMU1 304 aa21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.6 ms