RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 AGAP14A8MT82 685 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 GPR39O43194 453 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 LDB2O43679 373 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 KCNJ13O60928 360 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 ITGA2BP08514 1039 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 CD1CP29017 333 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 HADHAP40939 763 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 OR1D5P58170 312 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 GPLD1P80108 840 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 INSCQ1MX18 579 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 GPRC6AQ5T6X5 926 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 CLEC14AQ86T13 490 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 LINC00523Q86TU6 105 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 PIM3Q86V86 326 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 OR4K2Q8NGD2 314 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 GDAP1Q8TB36 358 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SLC46A1Q96NT5 459 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 KLC4Q9NSK0 619 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SLC23A2Q9UGH3 650 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 PLD2O14939 933 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UGT1A9O60656 530 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 VCLP18206 1134 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UGT1A6P19224 532 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UGT1A1P22309 533 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UGT1A4P22310 534 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 ALDH4A1P30038 563 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UGT1A3P35503 534 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UGT1A5P35504 534 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 FDFT1P37268 417 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 EPHA4P54764 986 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 XIAPP98170 497 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 HHEXQ03014 270 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 DMPKQ09013 629 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 NFATC2Q13469 925 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SPARCL1Q14515 664 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 PTPRCAPQ14761 206 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 CCNG2Q16589 344 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 ZNF398Q8TD17 642 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 MAIP1Q8WWC4 291 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 TTC25Q96NG3 672 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 KLHL33A6NCF5 533 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 H7C0S8 307 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 RRP8O43159 456 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SUN1O94901 812 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 PSMA3P25788 255 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 CSF2RBP32927 897 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 CA5AP35218 305 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 ULK4Q96C45 1275 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 UCK1Q9HA47 277 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 RDH14Q9HBH5 336 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 CPNE7Q9UBL6 633 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 KCTD3Q9Y597 815 aa16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 LILRA5A6NI73 299 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 DUX1O43812 170 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SNX2O60749 519 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 SEMA5AQ13591 1074 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.91■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.91■□□□□ 0.3
HERC3-214ENST00000601319 AMZ1Q400G9 498 aa16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms