RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 SYCE1Q8N0S2 351 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 LRRC57Q8N9N7 239 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 RCBTB1Q8NDN9 531 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 TAAR9Q96RI9 348 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 IL26Q9NPH9 171 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 IMPACTQ9P2X3 320 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 CPNE7Q9UBL6 633 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 AMFRQ9UKV5 643 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 PKP3Q9Y446 797 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa17.77■□□□□ 0.44
CTIF-209ENST00000591387 C9orf172C9J069 976 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 CCL4P13236 92 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 VCLP18206 1134 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 CHRNA4P43681 627 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ITGA9Q13797 1035 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 PRPSAP1Q14558 356 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 CRTC3Q6UUV7 619 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 WASH2PQ6VEQ5 465 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 GAS2L3Q86XJ1 694 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ACRBPQ8NEB7 543 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 TTC25Q96NG3 672 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ZMYND15Q9H091 742 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 WASH6PQ9NQA3 447 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 PRDM8Q9NQV8 689 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 LOC400499M0QZD8 3231 aa17.76■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 MGAQ8IWI9 3026 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 SDK2Q58EX2 2172 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 MACROD2A1Z1Q3 448 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 GRID2IPA4D2P6 1211 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 LILRA5A6NI73 299 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 PRR19A6NJB7 356 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 B4E171 279 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 IDSP22304 550 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 TSPAN7P41732 249 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 KIF5AQ12840 1032 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 NFATC2Q13469 925 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 LDLRAP1Q5SW96 308 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 RANBP10Q6VN20 620 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 PEX26Q7Z412 305 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 DTX1Q86Y01 620 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ZNF547Q8IVP9 402 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 UBL4BQ8N7F7 174 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 TTC13Q8NBP0 860 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 GDAP1Q8TB36 358 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ALG3Q92685 438 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 DDA1Q9BW61 102 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 FOXJ2Q9P0K8 574 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 SLC23A2Q9UGH3 650 aa17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 COL6A6A6NMZ7 2263 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 C5orf60A6NFR6 353 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 C2orf81A6NN90 581 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 F5H423 210 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 AGRPO00253 132 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 STX7O15400 261 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 KCNN4O15554 427 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 MTX2O75431 263 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 AGTP01019 485 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 VIPP01282 170 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 PYGMP11217 842 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 CDC25BP30305 580 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 RAB15P59190 212 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 CHRNA6Q15825 494 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 AGAP9Q5VTM2 703 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 TMEM139Q8IV31 216 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 DDHD1Q8NEL9 900 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 NCSTNQ92542 709 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 LRRC45Q96CN5 670 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 SPATA13Q96N96 652 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 C19orf43Q9BQ61 176 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 C10orf88Q9H8K7 445 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 SMOXQ9NWM0 555 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 TMEM9Q9P0T7 183 aa17.74■□□□□ 0.43
CTIF-209ENST00000591387 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms