RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP70Q8NHQ1 597 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 SYTL2Q9HCH5 934 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 HACD3Q9P035 362 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0D9SEW6 157 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 A8MT66 165 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 APBB3O95704 486 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ADH1CP00326 375 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ACADSP16219 412 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 PIK3R1P27986 724 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 STC1P52823 247 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf89Q6UX73 402 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 DENND1CQ8IV53 801 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 PHTF2Q8N3S3 785 aa25.24■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa25.24■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 TAF11Q15544 211 aa25.23■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 FRMD7Q6ZUT3 714 aa25.23■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM24O75264 130 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 KAT7O95251 611 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 KLKB1P03952 638 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ITGAXP20702 1163 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6V1C1P21283 382 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC13P55735 322 aa25.22■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS24P62847 133 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 ISCA2Q86U28 154 aa25.22■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 H0Y3Z8 333 aa25.21■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 EPN2O95208 641 aa25.21■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 CDKN2DP55273 166 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6V0D1P61421 351 aa25.21■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 PLK5Q496M5 336 aa25.21■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 NUF2Q9BZD4 464 aa25.21■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa25.21■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB26Q9HCK0 441 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 SPHK2Q9NRA0 654 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL5AQ9Y689 179 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 EML5Q05BV3 1969 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 H7C0S8 307 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 GFRA2O00451 464 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 SDHDO14521 159 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 CD1DP15813 335 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP4BP51164 291 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 MTTPP55157 894 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-204ENST00000587718 SULT2A1Q06520 285 aa25.2■■□□□ 1.62
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