RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CLCNKA	P51800	687 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.7	□□□□□ -0.54	3e-9	■■■□□ 16
USP22-211	ENST00000584538	TUBB2A	Q13885	445 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	BCL7A	Q4VC05	210 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	GKN2	Q86XP6	184 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	APOLD1	Q96LR9	279 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DPH5	Q9H2P9	285 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	GULP1	Q9UBP9	304 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SNX24	Q9Y343	169 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.7	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	NEMP2	A6NFY4	417 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SMAP	O00193	183 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CDK14	O94921	469 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ANXA6	P08133	673 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CKMT1A	P12532	417 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	MYF5	P13349	255 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CTSE	P14091	401 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ACTR1B	P42025	376 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PRLHR	P49683	370 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ACTR1A	P61163	376 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ITIH4	Q14624	930 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TRADD	Q15628	312 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PPM1J	Q5JR12	505 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	C8orf74	Q6P047	294 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	GPR156	Q8NFN8	814 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PATE1	Q8WXA2	126 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	COPS8	Q99627	209 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CDC6	Q99741	560 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SLC32A1	Q9H598	525 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	WHRN	Q9P202	907 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	KCNK6	Q9Y257	313 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		11.69	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	OR2AG2	A6NM03	316 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538		B4DGG1	531 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	KMO	O15229	486 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TNFSF14	O43557	240 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	USP1	O94782	785 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ALPPL2	P10696	532 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ACP1	P24666	158 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	AKT1	P31749	480 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	PRAME	P78395	509 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DMPK	Q09013	629 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CRYM	Q14894	314 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	HIF1A	Q16665	826 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	NAGS	Q8N159	534 aa		11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
USP22-211	ENST00000584538	ARL10	Q8N8L6	244 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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