RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 GPR3P46089 330 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 MAPK10P53779 464 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 HHEXQ03014 270 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NFATC2Q13469 925 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SPARCL1Q14515 664 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PDZD3Q86UT5 571 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC112Q8NEF3 446 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 OR10G6Q8NH81 332 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA13Q96N96 652 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 MFRPQ9BY79 579 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 UGT1A7Q9HAW7 530 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 UGT1A10Q9HAW8 530 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 UGT1A8Q9HAW9 530 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 IL26Q9NPH9 171 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 IL17CQ9P0M4 197 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 LOXL2Q9Y4K0 774 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 ARL5AQ9Y689 179 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PMS2P1A4D2B8 440 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 C5orf60A6NFR6 353 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 OR5K4A6NMS3 321 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 GPR89AB7ZAQ6 455 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP6O43182 974 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PPFIA2O75334 1257 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CRTAMO95727 393 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 EML2O95834 649 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 GPR89BP0CG08 455 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 F3P13726 295 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 VCLP18206 1134 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ITIH1P19827 911 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 MPSTP25325 297 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CD1CP29017 333 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 AKT1P31749 480 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PDX1P52945 283 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 GPLD1P80108 840 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TMPRSS15P98073 1019 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 OLIG2Q13516 323 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ITGA9Q13797 1035 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PTPRCAPQ14761 206 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TERF2Q15554 542 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 CHRNA6Q15825 494 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 PARP6Q2NL67 630 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 IYDQ6PHW0 289 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 SFRP1Q8N474 314 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 OR4K2Q8NGD2 314 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 KIF18AQ8NI77 898 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF398Q8TD17 642 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 NCSTNQ92542 709 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM159Q96B96 161 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 HES6Q96HZ4 224 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 VPS35Q96QK1 796 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 NUDT22Q9BRQ3 303 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 LZTFL1Q9NQ48 299 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms