RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577886.5

TRIM16-211, Transcript of tripartite motif containing 16, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM16, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16-211ENST00000577886 ESR1P03372 595 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 TSPAN8P19075 237 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 MAPK8P45983 427 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 CDH13P55290 713 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 CREMQ03060 361 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 GEN1Q17RS7 908 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 ANKS6Q68DC2 871 aa9.6□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 RETSATQ6NUM9 610 aa9.6□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 RNF111Q6ZNA4 994 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 Q6ZNB5 142 aa9.6□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 TWIST2Q8WVJ9 160 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 ASB9Q96DX5 294 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 ZBP1Q9H171 429 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.6□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 VPS51Q9UID3 782 aa9.6□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 BTN3A1O00481 513 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 GREM1O60565 184 aa9.59□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 ZNF711Q9Y462 761 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.59□□□□□ -0.87
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TRIM16-211ENST00000577886 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 MPP7Q5T2T1 576 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.59□□□□□ -0.87
TRIM16-211ENST00000577886 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.59□□□□□ -0.87
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