RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA46Q5T0L3 261 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KRT80Q6KB66 452 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 USP17L6PQ6QN14 398 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 AFTPHQ6ULP2 937 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NEK8Q86SG6 692 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC14AQ86T13 490 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ERICH1Q86X53 443 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G4DQ86XP0 818 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CMTM4Q8IZR5 234 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ADSSL1Q8N142 457 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SCML4Q8N228 414 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SFRP1Q8N474 314 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RNF169Q8NCN4 708 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 BHLHE23Q8NDY6 225 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KCNG4Q8TDN1 519 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 AFG1LQ8WV93 481 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC44A1Q8WWI5 657 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OR1E3Q8WZA6 343 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CPT1BQ92523 772 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NCSTNQ92542 709 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 NT5C3BQ969T7 300 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MUL1Q969V5 352 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC127Q96BQ5 260 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ALG14Q96F25 216 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 C14orf79Q96F83 325 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 VPS35Q96QK1 796 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MED15Q96RN5 788 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-204ENST00000577468 FOXB1Q99853 325 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 WDR11Q9BZH6 1224 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 GPR63Q9BZJ6 419 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OR51B5Q9H339 312 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SP140LQ9H930 580 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 EBF2Q9HAK2 575 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-204ENST00000577468 EMC7Q9NPA0 242 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-204ENST00000577468 SYBUQ9NX95 663 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 VPS51Q9UID3 782 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PN81 502 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 EFCAB10A6NFE3 127 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SLC15A5A6NIM6 579 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 IQCF5A8MTL0 148 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 ERVV-1B6SEH8 477 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 H3BNC9 293 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 DNM1LO00429 736 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRM-204ENST00000577468 SOCS6O14544 535 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KCNK3O14649 394 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRM-204ENST00000577468 TADA2AO75478 443 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PRDM1O75626 825 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RPP40O75818 363 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TOX4O94842 621 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 CCNB2O95067 398 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 KCNK5O95279 499 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 RAB3DO95716 219 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TGM6O95932 706 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-204ENST00000577468 MMP2P08253 660 aa3.04□□□□□ -1.92
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