RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDC7O00311 574 aa28.79■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TUBB3Q13509 450 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT72Q14CN4 511 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 LIPIQ6XZB0 460 aa28.79■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR56A5P0C7T3 313 aa28.77■■■□□ 2.2
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SMRP1Q8NCR6 262 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-208ENST00000573600 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-208ENST00000573600 NSL1Q96IY1 281 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-208ENST00000573600 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDH23Q9H251 3354 aa28.74■■■□□ 2.19
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