RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 MLNP12872 115 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 F3P13726 295 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TPH1P17752 444 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 PAMP19021 973 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 PSMA3P25788 255 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CASQ1P31415 396 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEA6P43360 314 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 FASLGP48023 281 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 PRAMEP78395 509 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TMPRSS15P98073 1019 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 XIAPP98170 497 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 KCTD16Q68DU8 428 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC8BQ6P9F7 803 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 AFTPHQ6ULP2 937 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 AMZ2Q86W34 360 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CCL4L1Q8NHW4 92 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 SLCO2A1Q92959 643 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TSSK1BQ9BXA7 367 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TCAF1Q9Y4C2 921 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 RP1P56715 2156 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEB16A2A368 324 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT1A9O60656 530 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 AP2A2O94973 939 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBB4AP04350 444 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT1A6P19224 532 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT1A1P22309 533 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT1A4P22310 534 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ACRV1P26436 265 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT1A3P35503 534 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT1A5P35504 534 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 GPLD1P80108 840 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 DMPKQ09013 629 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ITIH4Q14624 930 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 NR1D2Q14995 579 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 BCL7AQ4VC05 210 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CDCP2Q5VXM1 449 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM220Q6QAJ8 160 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CCNJLQ8IV13 435 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM48Q8IWZ4 208 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 LSMEM2Q8N112 164 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ARL14Q8N4G2 192 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 GLIS1Q8NBF1 620 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 SGSM3Q96HU1 749 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM74Q96NL1 305 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 STRADBQ9C0K7 418 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 NRSN2Q9GZP1 204 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT1A7Q9HAW7 530 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT1A10Q9HAW8 530 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT1A8Q9HAW9 530 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ASXL3Q9C0F0 2248 aa15.56■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 NSG1P42857 185 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 EPHA4P54764 986 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 PERM1Q5SV97 790 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TTC27Q6P3X3 843 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF438Q7Z4V0 828 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 NAGSQ8N159 534 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 SFRP1Q8N474 314 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 MCUQ8NE86 351 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM159Q96B96 161 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC38A3Q99624 504 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRN3Q9H3W5 708 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNK6Q9Y257 313 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 KCTD3Q9Y597 815 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF215Q9Y6U7 377 aa15.55■□□□□ 0.08
RABGGTA-205ENST00000558534 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms