RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 INSCQ1MX18 579 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MAP9Q49MG5 647 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PHF19Q5T6S3 580 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SEL1L2Q5TEA6 688 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MEI1Q5TIA1 1274 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KCTD11Q693B1 232 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C11orf96Q7Z7L8 435 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PDZD3Q86UT5 571 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR4K2Q8NGD2 314 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARNT2Q9HBZ2 717 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LZTFL1Q9NQ48 299 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KCNK4Q9NYG8 393 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FKBPLQ9UIM3 349 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM208BQ5VWN6 2430 aa13.05□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZW10O43264 779 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPFIA2O75334 1257 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCDC175P0C221 793 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ITIH1P19827 911 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ETV5P41161 510 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HHEXQ03014 270 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NFATC2Q13469 925 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SQSTM1Q13501 440 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ITGA9Q13797 1035 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C16orf72Q14CZ0 275 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPS6KA1Q15418 735 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LDLRAP1Q5SW96 308 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF662Q6ZS27 426 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CLEC14AQ86T13 490 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC9B2Q86UD5 537 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RCBTB1Q8NDN9 531 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR13C4Q8NGS5 318 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF398Q8TD17 642 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BRSK1Q8TDC3 778 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC38A3Q99624 504 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TIMM29Q9BSF4 260 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM9Q9P0T7 183 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PISDQ9UG56 409 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.04□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 A0A0G2JNG1 304 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KIR2DS3K7RE56 304 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LIASO43766 372 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CRTAMO95727 393 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ITGA2BP08514 1039 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC2A4P14672 509 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BRAFP15056 766 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TPH1P17752 444 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MPSTP25325 297 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC5A2P31639 672 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CSF2RBP32927 897 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CTSCP53634 463 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LIMK2P53671 638 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMPRSS15P98073 1019 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 XIAPP98170 497 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TLE3Q04726 772 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GTF2H3Q13889 308 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KIR2DS5Q14953 304 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OASLQ15646 514 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GPRC6AQ5T6X5 926 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM220Q6QAJ8 160 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MICALCLQ6ZW33 695 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DDHD1Q8NEL9 900 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NAT14Q8WUY8 206 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C1orf54Q8WWF1 131 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KCNE4Q8WWG9 221 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RTP4Q96DX8 246 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCDC74BQ96LY2 380 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TTC25Q96NG3 672 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.03□□□□□ -0.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR2AG2A6NM03 316 aa13.02□□□□□ -0.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR5K4A6NMS3 321 aa13.02□□□□□ -0.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCL22O00626 93 aa13.02□□□□□ -0.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LDB2O43679 373 aa13.02□□□□□ -0.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 POP7O75817 140 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRAMEF1O95521 474 aa13.02□□□□□ -0.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 JMJD7P0C870 316 aa13.02□□□□□ -0.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCL4P13236 92 aa13.02□□□□□ -0.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms