RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf74Q86VG3 221 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CPNE9Q8IYJ1 553 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0U1RQF3 1178 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SIN3BO75182 1162 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 FABP3P05413 133 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 RB1P06400 928 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 BMP6P22004 513 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 VIPR1P32241 457 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 RIPK1Q13546 671 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 C16orf46Q6P387 395 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SMYD1Q8NB12 490 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 HERVK_113Q902F9 699 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 THRSPQ92748 146 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ABCG4Q9H172 646 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 COG5Q9UP83 839 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SNAPC5O75971 98 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ANPEPP15144 967 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MTHFRP42898 656 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF132P52740 706 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 LIN54Q6MZP7 749 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 C12orf29Q8N999 325 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CPT1BQ92523 772 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 TOP1MTQ969P6 601 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 NUS1Q96E22 293 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 AGAP2Q99490 1192 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 NUAK2Q9H093 628 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SPTLC1O15269 473 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PRAMEF1O95521 474 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 EPHX1P07099 455 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 C8AP07357 584 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 FSHRP23945 695 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SOX11P35716 441 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 GHRHRQ02643 423 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 GCNT7Q6ZNI0 430 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM110Q86TL2 294 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf65Q8NCR3 313 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 OR2T3Q8NH03 318 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO30Q8TB52 745 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 FCGR1BQ92637 280 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 NACC2Q96BF6 587 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 RHBGQ9H310 441 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 KLHL31Q9H511 634 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 KLHL1Q9NR64 748 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 IRAK3Q9Y616 596 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0J9YYE9 177 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 GRIA3P42263 894 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CLCQ05315 142 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PWP1Q13610 501 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 RTL4Q6ZR62 310 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PIGXQ8TBF5 258 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MOAP1Q96BY2 351 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CLCC1Q96S66 551 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 NDNQ99608 321 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CPQQ9Y646 472 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 G3V2T6 193 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 DNM1LO00429 736 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 OR10H3O60404 316 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 COQ9O75208 318 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms