RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 PAF1Q8N7H5 531 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNJ9Q92806 393 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPT3HB4E1H0 165 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 BNIP3LO60238 219 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPT3HO75486 399 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ESR1P03372 595 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TSPAN8P19075 237 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 LTBRP36941 435 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 VHLP40337 213 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CDH13P55290 713 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MYLK3Q32MK0 819 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NDE1Q9NXR1 346 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC189A1A4V9 331 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 UBDO15205 165 aa20.06■□□□□ 0.8
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PACSIN3-211ENST00000539589 NIPSNAP2O75323 286 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 FKBP6O75344 327 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 GPC4O75487 556 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE5AO76074 875 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NFATC1O95644 943 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ALPIP09923 528 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TAF11Q15544 211 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC6AQ6EIG7 209 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 UGT3A1Q6NUS8 523 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 Q6ZVU0 165 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CHST14Q8NCH0 376 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 EID2BQ96D98 161 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP44Q9C0F1 390 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 GALPQ9UBC7 116 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 E5RI56 91 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF4P08620 206 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CD1EP15812 388 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CHRM3P20309 590 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MTTPP55157 894 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 IL2P60568 153 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NAA20P61599 178 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CARD16Q5EG05 197 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 DSELQ8IZU8 1212 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 FRS2Q8WU20 508 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINI1Q99574 410 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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PACSIN3-211ENST00000539589 BTN3A1O00481 513 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ECI2O75521 394 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK14O94921 469 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TRBC1P01850 177 aa20.05■□□□□ 0.8
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PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 RCN3Q96D15 328 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.05■□□□□ 0.8
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PACSIN3-211ENST00000539589 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PRRT4C9JH25 899 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC7O00311 574 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ART3Q13508 389 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRE1Q14246 886 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 HPS6Q86YV9 775 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CD200R1Q8TD46 325 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 JADE3Q92613 823 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 FGF14Q92915 247 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NXPE3Q969Y0 559 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 C19orf60Q96EN9 201 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF570Q96NI8 536 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC1Q99614 292 aa20.04■□□□□ 0.8
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