RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 SQSTM1Q13501 440 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 MAP9Q49MG5 647 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 GPRC6AQ5T6X5 926 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC9B2Q86UD5 537 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 AVL9Q8NBF6 648 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 ASCL3Q9NQ33 180 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 PRDM8Q9NQV8 689 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 THSD1Q9NS62 852 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNK4Q9NYG8 393 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 FKBPLQ9UIM3 349 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 RRP8O43159 456 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 GPR39O43194 453 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNJ13O60928 360 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 SRP72O76094 671 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 IFNB1P01574 187 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 CA5AP35218 305 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 HADHAP40939 763 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 HHEXQ03014 270 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 SNX1Q13596 522 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 CCNG2Q16589 344 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 USP53Q70EK8 1073 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 RAB11FIP2Q7L804 512 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 LINC00523Q86TU6 105 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 SLITRK4Q8IW52 837 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 MAIP1Q8WWC4 291 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 SH3KBP1Q96B97 665 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 DCBLD2Q96PD2 775 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC38A3Q99624 504 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 ASB8Q9H765 288 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 RDH14Q9HBH5 336 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 KIF26BQ2KJY2 2108 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 PRR19A6NJB7 356 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 PLD2O14939 933 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 LDB2O43679 373 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 VCLP18206 1134 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 FDFT1P37268 417 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 GPLD1P80108 840 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 XIAPP98170 497 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 FOXR1Q6PIV2 292 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 C11orf96Q7Z7L8 435 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 OR13C4Q8NGS5 318 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM159Q96B96 161 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 DPYSL5Q9BPU6 564 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 CHD6Q8TD26 2715 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN4-217ENST00000527644 FGGP02679 453 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 TPH1P17752 444 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 MSH3P20585 1137 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 NFATC2Q13469 925 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SEMA6CQ9H3T2 930 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ETNK1Q9HBU6 452 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CPNE7Q9UBL6 633 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PMS2P1A4D2B8 440 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 AGAP14A8MT82 685 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 TNFSF15O95150 251 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 IDSP22304 550 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 LONRF2Q1L5Z9 754 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PHF19Q5T6S3 580 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 NKAIN2Q5VXU1 208 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM220Q6QAJ8 160 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 WASH2PQ6VEQ5 465 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC89Q8N998 374 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 OR10G6Q8NH81 332 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 NUDT22Q9BRQ3 303 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 WASH6PQ9NQA3 447 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PDZK1P1A8MUH7 402 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CDRT15L2A8MXV6 281 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CEP104O60308 925 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 POP7O75817 140 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ITGA2BP08514 1039 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 AKT1P31749 480 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CTSCP53634 463 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 TMPRSS15P98073 1019 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 AGAP9Q5VTM2 703 aa25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms