RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526874.5

CTR9-203, Transcript of CTR9 homolog, Paf1/RNA polymerase II complex component, human

TSL 4

Gene CTR9, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTR9-203	ENST00000526874	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	LINC00473	A8K010	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	T	O15178	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	TTI1	O43156	1089 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	SELENOF	O60613	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ERLIN1	O75477	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	LCAT	P04180	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	FUT1	P19526	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	NR2F2	P24468	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	POU1F1	P28069	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	CCR1	P32246	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	SERPINB6	P35237	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	GJC1	P36383	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	LIPA	P38571	399 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	GABRB2	P47870	512 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	GAD2	Q05329	585 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ITIH3	Q06033	890 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	OVGP1	Q12889	678 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	OLIG2	Q13516	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	KCNC3	Q14003	757 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	KRT39	Q6A163	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	GPAT4	Q86UL3	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTR9-203	ENST00000526874	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874		A0A0B4J293	547 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874		F8WDY8	70 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	MPPED1	O15442	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	MTX2	O75431	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	MED24	O75448	989 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	SLC25A12	O75746	678 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	ZWINT	O95229	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	RLN1	P04808	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	TCF4	P15884	667 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	CYP11B2	P19099	503 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	GPT	P24298	496 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	CDA	P32320	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	RFC4	P35249	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	NXPH1	P58417	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	E2F2	Q14209	437 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTR9-203	ENST00000526874	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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