RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516564.1

RNU6-358P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 358, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-358P, Length 75 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-358P-201ENST00000516564 NEXNQ0ZGT2 675 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 GALNT2Q10471 571 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ENPP2Q13822 863 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 DUOXA1Q1HG43 343 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ASPRV1Q53RT3 343 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 XKR6Q5GH73 641 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 BSPRYQ5W0U4 402 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 LCN10Q6JVE6 187 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 BMPERQ8N8U9 685 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 GTF3C6Q969F1 213 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PRAC1Q96KF2 57 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 TRIM51Q9BSJ1 452 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ISCA1Q9BUE6 129 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 BRF2Q9HAW0 419 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 VEZTQ9HBM0 779 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ASIC3Q9UHC3 531 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 BUD23O43709 281 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 TCEA3O75764 348 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZFAND5O76080 213 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 NADKO95544 446 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 EML2O95834 649 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 CLPTM1O96005 669 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 NGFP01138 241 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 HMBSP08397 361 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 LIFP15018 202 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 TYMPP19971 482 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ABCD1P33897 745 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PPFIA1Q13136 1202 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 GPR68Q15743 365 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 SNAI3Q3KNW1 292 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 CDONQ4KMG0 1287 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 NAA35Q5VZE5 725 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 LRRTM4Q86VH4 590 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 SCML4Q8N228 414 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF843Q8N446 348 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PAF1Q8N7H5 531 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 AMER3Q8N944 861 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 TRIM63Q969Q1 353 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 COPG2Q9UBF2 871 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 STK39Q9UEW8 545 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 SARDHQ9UL12 918 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZHX2Q9Y6X8 837 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PCNX3Q9H6A9 2034 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 TRMUO75648 421 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 NKX2-2O95096 273 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 MOCS3O95396 460 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ITGA3P26006 1051 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 CNTFP26441 200 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 EPHA2P29317 976 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 RHBDL3P58872 404 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PPARDQ03181 441 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 UGP2Q16851 508 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 GTDC1Q4AE62 458 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF613Q6PF04 617 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF614Q8N883 585 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 OR1J2Q8NGS2 313 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 TMEM68Q96MH6 324 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 SEMA3CQ99985 751 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 ABI3Q9P2A4 366 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 GJD2Q9UKL4 321 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 MKLN1Q9UL63 735 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 CAPN7Q9Y6W3 813 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-358P-201ENST00000516564 PIP5K1CO60331 668 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 BMP10O95393 424 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC6A12P48065 614 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 SLC8A3P57103 927 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 CD81P60033 236 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 SP3Q02447 781 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 OLIG2Q13516 323 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 RAB6CQ53S08 254 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 FAM69AQ5T7M9 428 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-358P-201ENST00000516564 ALS2CLQ60I27 953 aa2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms