RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 TIAF1O95411 115 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 CLDN1O95832 211 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 FOLR1P15328 257 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 IDSP22304 550 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF165P49910 485 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 ACY1Q03154 408 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 GPR18Q14330 331 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 UBXN4Q92575 508 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 MR1Q95460 341 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 LYSMD1Q96S90 227 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 FANCLQ9NW38 375 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 TRIM10Q9UDY6 481 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
SH3BP2-215ENST00000510074 A6NL46 340 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 PRLP01236 227 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 RARAP10276 462 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IL1R2P27930 398 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 KRT81Q14533 505 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 KCNAB1Q14722 419 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF569Q5MCW4 686 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ALS2CLQ60I27 953 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 KLHL35Q6PF15 583 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 LRRTM4Q86VH4 590 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 HPS6Q86YV9 775 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF653Q96CK0 615 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 C5orf34Q96MH7 638 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ADGRE3Q9BY15 652 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 RAB33BQ9H082 229 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SCINQ9Y6U3 715 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 WIPF3A6NGB9 483 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 LGALS16A8MUM7 142 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF185O15231 689 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MATN3O15232 486 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 VCLP18206 1134 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 PTGIRP43119 386 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IL10RAQ13651 578 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IHHQ14623 411 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 FDCSPQ8NFU4 85 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 PNPLA2Q96AD5 504 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC41A2Q96JW4 573 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 PHF12Q96QT6 1004 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 FGF21Q9NSA1 209 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 AMACRQ9UHK6 382 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 MED13Q9UHV7 2174 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CHUKO15111 745 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 SCRG1O75711 98 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM63AO94886 807 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 CDK14O94921 469 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 LDLRP01130 860 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 EBLN1P0CF75 366 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 BRAFP15056 766 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 IL4RP24394 825 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TNFRSF8P28908 595 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 HALP42357 657 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 NR6A1Q15406 480 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 QPCTQ16769 361 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 Q8NA96 180 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 GLYATL1Q969I3 302 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TCTN2Q96GX1 697 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 ERGIC2Q96RQ1 377 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2-215ENST00000510074 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms