RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM74Q86UV6 250 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 AMZ2Q86W34 360 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 APOLD1Q96LR9 279 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TCF12Q99081 682 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CLPBQ9H078 707 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CHRAC1Q9NRG0 131 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 WHRNQ9P202 907 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CEP250Q9BV73 2442 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0G2JNG1 304 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM38O00635 465 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 RFPL3O75679 317 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 USP1O94782 785 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 GOT2P00505 430 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 GLB1P16278 677 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 IDSP22304 550 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNA4P22459 653 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 PMLP29590 882 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 HALP42357 657 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPRCAPQ14761 206 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 KIR2DS5Q14953 304 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 BCL7AQ4VC05 210 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 C8orf74Q6P047 294 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 PACS1Q6VY07 963 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC6Q86X45 466 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCG4Q9H172 646 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 GULP1Q9UBP9 304 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 PADI4Q9UM07 663 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM63AO94886 807 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 FTH1P02794 183 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 OR56A5P0C7T3 313 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 GIMD1P0DJR0 217 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 ACP5P13686 325 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEA3P43357 314 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TERF1P54274 439 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 C2orf54Q08AI8 447 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 DMPKQ09013 629 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 HIF1AQ16665 826 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF534Q76KX8 674 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM135Q86UB9 458 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR156Q8NFN8 814 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 KLC4Q9NSK0 619 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 TREX1Q9NSU2 369 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP2-208ENST00000504294 SYBUQ9NX95 663 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms