RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A6NLC8 198 aa4.49□□□□□ -1.69
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CACNG1Q06432 222 aa4.49□□□□□ -1.69
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