RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	WASH4P	A8MWX3	477 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	GFPT2	O94808	682 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ASMTL	O95671	621 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CP	P00450	1065 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	GM2A	P17900	193 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	VIPR1	P32241	457 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FASLG	P48023	281 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RENBP	P51606	427 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	AP1S1	P61966	158 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF235	Q14590	738 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SYCP1	Q15431	976 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	VWA3B	Q502W6	1294 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	LZTR1	Q8N653	840 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DTD2	Q96FN9	168 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRY4	Q9C004	299 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CASS4	Q9NQ75	786 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	KCND3	Q9UK17	655 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CROT	Q9UKG9	612 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TLK1	Q9UKI8	766 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FZD10	Q9ULW2	581 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQ67	120 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PIPSL	A2A3N6	862 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NCN8	305 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511		F8VZ95	297 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS2	O15393	492 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CCP110	O43303	1012 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	UCHL3	P15374	230 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB6A	P20340	208 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	F8A1	P23610	371 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP14	P31944	242 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	AIF1	P55008	147 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CDR2	Q01850	454 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR59	Q6PJI9	974 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZVL8	140 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SFRP1	Q8N474	314 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	STK35	Q8TDR2	534 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	STK33	Q9BYT3	514 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC19	Q9H756	370 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PDP2	Q9P2J9	529 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		10.73	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX2	O60749	519 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA7A	O75326	666 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CALB1	P05937	261 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A4	P14672	509 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR7	P34969	479 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PGD	P52209	483 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PMS2	P54278	862 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	USP45	Q70EL2	814 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM135	Q86UB9	458 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM74	Q86UV6	250 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	BBS5	Q8N3I7	341 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	AP2M1	Q96CW1	435 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	MCEE	Q96PE7	176 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69

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