RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	NFATC2	Q13469	925 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT33B	Q14525	404 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SFRP1	Q8N474	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR24	Q96S15	920 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	IL26	Q9NPH9	171 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SMOX	Q9NWM0	555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087WV48	116 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PQM1	296 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	QSOX1	O00391	747 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CHUK	O15111	745 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	LIAS	O43766	372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF5C	O60282	957 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MTX2	O75431	263 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	FGG	P02679	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	FUCA1	P04066	466 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CD82	P27701	267 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TMPRSS15	P98073	1019 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	B4GALNT1	Q00973	533 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SNX1	Q13596	522 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	GSE1	Q14687	1217 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	NR1D2	Q14995	579 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CCNG2	Q16589	344 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KCTD16	Q68DU8	428 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	USP53	Q70EK8	1073 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	EID2B	Q96D98	161 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	COPS8	Q99627	209 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	POT1	Q9NUX5	634 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PISD	Q9UG56	409 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	RP1	P56715	2156 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	HEATR9	A2RTY3	570 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2AG2	A6NM03	316 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PFDN6	O15212	129 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP3K7	O43318	606 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	GSTM1	P09488	218 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MC4R	P32245	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ADRA1A	P35348	466 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT1A5	P35504	534 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPK10	P53779	464 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	GSTM4	Q03013	218 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SPARCL1	Q14515	664 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	POU6F1	Q14863	301 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCL1	Q15111	1095 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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