RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	IL37	Q9NZH6	218 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	PTPRD	P23468	1912 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293		O00370	1275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	COCH	O43405	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	KRT86	O43790	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ATG13	O75143	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	UBXN7	O94888	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SUN1	O94901	812 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	IRF1	P10914	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	UCHL3	P15374	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF18	P17022	549 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CHRM3	P20309	590 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	GATA3	P23771	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CHKA	P35790	457 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	STAT1	P42224	750 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ABCG1	P45844	678 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	RGS7	P49802	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	GAD2	Q05329	585 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF77	Q15935	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	MEA1	Q16626	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SHC3	Q92529	594 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TBCB	Q99426	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	POLH	Q9Y253	713 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CCL26	Q9Y258	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	C5orf42	Q9H799	3197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-240	ENST00000495293	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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