RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 PMPCBO75439 489 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 STK17BO94768 372 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 NDST3O95803 873 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 C9P02748 559 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 BRAFP15056 766 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TYRP1P17643 537 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 POLE2P56282 527 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 INSCQ1MX18 579 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 LRRTM4Q86VH4 590 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 AVL9Q8NBF6 648 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 C9orf72Q96LT7 481 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TEKT5Q96M29 485 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 BPIFA1Q9NP55 256 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 DLGAP3O95886 979 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 VIPP01282 170 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD34CP0C6C1 535 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TNNT1P13805 278 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 PTPN3P26045 913 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 KCNAB2Q13303 367 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM14Q14142 442 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 RNF31Q96EP0 1072 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 VEGFDO43915 354 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 UBXN7O94888 489 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CDK14O94921 469 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 PRKAR1AP10644 381 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CCR10P46092 362 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ABHD18Q0P651 414 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 NOMO1Q15155 1222 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 VSTM4Q8IW00 320 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC42Q96M95 316 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TGM7Q96PF1 710 aa22.04■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF28P17035 718 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CDKN2BP42772 138 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 WASHC5Q12768 1159 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 LLGL1Q15334 1064 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TAZQ16635 292 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CATSPER2Q96P56 530 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 VPS35Q96QK1 796 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CBFA2T2O43439 604 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 MFAP3LO75121 409 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 AMD1P17707 334 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 COMTP21964 271 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 HMGCLP35914 325 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 SLC1A1P43005 524 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 NR2C2P49116 596 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 SEPHS1P49903 392 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 SH3BP2P78314 561 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 FOXM1Q08050 763 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ADCY2Q08462 1091 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 CDC20Q12834 499 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TCEAL1Q15170 157 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 KDELC1Q6UW63 502 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 WASH2PQ6VEQ5 465 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 RSC1A1Q92681 617 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 IL26Q9NPH9 171 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGAP6O43182 974 aa22.01■■□□□ 1.11
POLR2F-211ENST00000488684 NFKB1P19838 968 aa22.01■■□□□ 1.11
POLR2F-211ENST00000488684 IDSP22304 550 aa22.01■■□□□ 1.11
POLR2F-211ENST00000488684 F8A1P23610 371 aa22.01■■□□□ 1.11
POLR2F-211ENST00000488684 CA5AP35218 305 aa22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms