RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 MC2RQ01718 297 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 LINC00303Q3SY05 128 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 ANKS6Q68DC2 871 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 PLXDC1Q8IUK5 500 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF567Q8N184 647 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 GDAP1Q8TB36 358 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 EXTL1Q92935 676 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 HAUS1Q96CS2 278 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 HACD3Q9P035 362 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPN4-211ENST00000488279 LILRA5A6NI73 299 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 GTF2H3Q13889 308 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 DAAM2Q86T65 1068 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 EXD3Q8N9H8 876 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 BRSK1Q8TDC3 778 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 TTC25Q96NG3 672 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 IL26Q9NPH9 171 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 FBXO8Q9NRD0 319 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 KLHL3Q9UH77 587 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 TFR2Q9UP52 801 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 VCLP18206 1134 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 IDSP22304 550 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 SLC19A1P41440 591 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 MARCKSL1P49006 195 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 CYP4F2P78329 520 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 MPP3Q13368 585 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 NOMO1Q15155 1222 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 SLC1A5Q15758 541 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 PPP2R5EQ16537 467 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.25■■□□□ 1.15
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PTPN4-211ENST00000488279 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.25■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 DTX3LQ8TDB6 740 aa22.25■■□□□ 1.15
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PTPN4-211ENST00000488279 F5H423 210 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 RAD1O60671 282 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 UBXN7O94888 489 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 AMD1P17707 334 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 HLA-DPA1P20036 260 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 CHRNA4P43681 627 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 XRCC4Q13426 336 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 TBR1Q16650 682 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 CCDC181Q5TID7 509 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 WASH2PQ6VEQ5 465 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 IPMKQ8NFU5 416 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 KRT35Q92764 455 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 RTP4Q96DX8 246 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 CTRCQ99895 268 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 IL17CQ9P0M4 197 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 PILRAQ9UKJ1 303 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 PKP3Q9Y446 797 aa22.24■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
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PTPN4-211ENST00000488279 J3QKU1 62 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 KCNJ13O60928 360 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 PPFIA2O75334 1257 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 SFTPCP11686 197 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 TYRP1P17643 537 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 SPAM1P38567 509 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 COPS2P61201 443 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 CHRNA6Q15825 494 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 BBS12Q6ZW61 710 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 COL6A6A6NMZ7 2263 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPN4-211ENST00000488279 H7C0C1 242 aa22.22■■□□□ 1.15
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